河南省水循环模拟与水环境保护国际联合实验室（Henan International Joint Laboratory of Water Cycle Simulation and Environmental Protection，简称HWSEP）, 于2021年1月由河南省科技厅批准成立，依托于郑州大学水资源与水环境团队，发挥郑州大学水科学研究多学科交叉优势和与国外科研机构广泛合作优势，旨在建成面向国家重大战略需求和国际学术前沿问题，开展水循环模拟、人水关系调控、水资源利用、水环境保护的国际联合研究和实验平台建设。该实验室重点研究：水循环模拟与和谐调控、水资源高效利用与安全保障、水污染治理与水环境保护。

郑州市水资源与水环境重点实验室（Zhengzhou Key Laboratory of Water Resource and Environment，简称ZWRE）, 于2018年12月由郑州市科学技术局批准成立，依托于郑州大学水资源与水环境团队，发挥郑州大学关于水的多学科交叉融合优势，旨在建成涉及水利、环境、生态、地理、信息、管理的跨学科综合研究和实验平台，为有效解决水资源短缺、水环境污染等治理提供技术支持。该实验室重点研究：人水关系和谐调控、水资源优化配置与高效利用、水环境综合治理体系。