依托完善的生态与良好的兼容性，国家超级计算郑州中心面向众多不同领域与行业应用需求，提供高性能计算、人工智能、大数据、行业应用等软件资源服务。其中应用开发基础环境由编程模型、编译系统、并行开发运行环境组成，支持MPI-1/MPI-2/MPI-3标准，支持OpenMP，兼容OpenCL和CUDA环境，编译器支持标准的C/C++、Fortran等语言，为用户的开发和调试提供极大的便利。行业应用软件主要面向各个行业应用领域提供软件服务功能。
行业应用软件
序号 |
应用领域 |
应用软件（DCU） |
应用软件（CPU） |
1 |
计算化学、材料、物理、分子动力学等领域 |
Gromacs-DCU Lammps-DCU Nwchem-DCU Hoomd-DCU MISA-MD-DCU NAMD-DCU |
ABINIT、 Amber、 BigDFT 、 CP2K、 Code-Aster、Gromacs、 Gamess、Lammps、 NAMD、 NWChem、 Vtst、 Openmx、 Openbabel、Quantum Espresso、 MISA-SCD、MISA-MD、 QMCPACK、 MISA-AKMC、Particle、 SIESTA |
2 |
计算生物学、精准医疗领域 |
OpenMM-DCU AutoDock-DCU Barracuda-DCU |
Amber、 AlloType、Canu、 Coot 、Picard、 Trimmomatic、 Situs、Bedtools、FastQC、 Samtools、GATK、 BWA |
3 |
气象、海洋、天文、环境模拟领域 |
—— |
WRF、 FDS、Gsac、 FVCOM 、ROMS、 CMAQ、 |
4 |
流体力学、结构分析领域 |
—— |
Elmer、 OpenFOAM、MiniFE |
5 |
冷冻电镜 |
Relion-DCU |
cisTEM、 ResMap、Ccpem、 Ctftilt、 Ctffind |
6 |
人工智能、神经网络等领域 |
Pytorch Tensorflow |
Anaconda、 Harris、SAC |
基础软件
序号 |
分类 |
基础软件 |
1 |
工具类 |
ParaView、python、R DUNE、IMOD、ipm octave、octave-mt、octopus singularity、spider、SU2 wxWidgets、Go、Qt |
2 |
数学库 |
boost |
3 |
基础库 |
htslib |
4 |
图像工具 |
gnuplot、xmgrace、EMAN、 FlameGraph、frealign、ploticus、 unblur、protomo |
5 |
编译软件 |
Calculix |
编译并行环境
序号 |
分类 |
编译环境 |
备注 |
1 |
编译器 |
gcc/g++ gfortran |
gcc/g++：7.3.1 gfortran：7.3.1 |
2 |
DCU异构编程环境 |
HIP编译器hipcc hcc编译器hcc opencl编译器hcc |
HIP编译器hipcc：2.8.19361 hcc编译器hcc：2.8.19361 opencl编译器hcc：2.8.19361 |
3 |
并行编程环境 |
hpcx-2.7.4 |
MPI：hpcx-2.7.4 |
4 |
函数库 |
CPU数学库：hygonBlis、 fftw、hdf5、jasper、 libpng、netcdf、zlib DCU数学库：rocblas、hipcub、 rocfft、rocsparse、rocrand、 深度学习库：miopen opencl库：opencl |
hygonBlis ：CPU BLAS库 fftw：CPU FFTW库 rocblas：加速卡BLAS库 rocfft：加速卡FFT库 |
用户须知：
1.上述软件列表为先进计算平台部分已安装的软件，用户可通过设置环境变量直接使用；
2.如果用户已经购买或通过其它方式获取了相关软件的许可，需要在“嵩山”超级计算机上使用这些软件，请用户安装在本人工作目录下，仅限用户本人使用并对其合法性负责；
3.用户如有软件的移植、安装、兼容性测试需求，可联系相关工作人员。