河南省医药科学研究院（以下简称“医药院”）研究生培养最早追溯到1983年与河南医学院基础部联合申报病理学和病理生理学博士学位授予点。此后，医药院研究生导师大多依托基础部（现基础医学院）、一附院、二附院、药学院和生科院招收博士生和硕士生，培养了一批又一批优秀硕士、博士毕业生，成为我省医学科研中坚力量。

2016年依托学校海外虚拟研究院政策，开始与美国德州大学联合培养博士生。2017年获郑州大学独立招生名额，依托医学科学院招收免疫学、生物化学与分子生物学和药理学科学学位硕士研究生。2018年学校与深圳华大基因科技有限公司和深圳华大生命科学研究院联合共建成立郑州大学华大基因学院，依托医药院建设运行，设生物学和生物与医药2个硕士学位授权点。2023年生物与医药硕士研究生由郑州大学生命科学院代招。

医药院现有博士生导师3人，硕士生导师28人。在读博士研究生3人、硕士研究生139人。自2019年开始，依据学科特色，结合学校一级学科培养方案，科学合理的制定研究生的培养方案，完成研究生课程的设置。目前开设专业必修课：11门，专业选修课16门。

医药院依托海外优青、国家重大科技专项、军工类项目、国家自然科学基金、省重大科技专项等纵向项目，和郑州市协同创新等横向项目，取得多项重大科技成果，其中导师和研究生以共通讯或共一作身份在Cell(细胞）、Nature(自然）和Science（科学）发表论文，产生了广泛学术影响。